В верхнее меню можно добавлять дополнительные разделы и подразделы
Зайдите в меню галочка, выберите "Создать раздел" и этот раздел появится в верхнем меню
Верхнее меню также содержит в себе себе ссылку на страницу "Главная" (в магазине эта страница называется "Каталог")
Система тегов позволяет создавать такие структуры, но все-таки, чтобы не запутаться, мы рекомендуем обычную "древовидную" структуру.
Не стоить сильно "дробить" разделы. Если Ваш товар будет слишком глубоко спрятан, клиент его просто не найдет.